アニメ「ゲゲゲの鬼太郎」の放送が始まり50周年。「妖怪」に連れられ東京の妖怪スポットをぶらりする街ぶら番組「ぶらり東京?妖怪夜行」。その内容は…。
お笑いコンビ銀シャリと元NMB48の門脇佳奈子、吉本坂46の三秋里歩による妖怪の謎をさがす街ブラ番組のロケ。しかし銀シャリの鰻が遅刻して来ない。仕方ないので３人で撮影を始めるが、そこに突然、雷鳴が！
登場したのは何と目玉おやじ。「そのようなことで妖怪の謎がわかるか！妖怪夜行へ案内するのじゃ！」
目玉おやじの命を受けた銀シャリの鰻ならぬウナギの妖怪に連れられて一行は都内の妖怪スポットへ。
妖怪夜行で出会った妖怪を愛する人たち、そこからみつけた現代人が忘れがちな「大切なもの」とは･･･